根据针灸推拿医生的多年临床实践证明，小儿针灸与大人不同。小儿自出生后，身体就开始全面发育，身体的形态、结构和各项功能都在迅速不断向着成熟、完善的方向发展，年龄越小，这种发育速度就越快。同时，小儿在整个生长发育过程中，抵抗力也就是免疫力低下，经常容易生病。但另一方面，小儿生病后又易于恢复。根据中医针灸的理论再结合这些特点，在给小儿扎针时，我们常用小针、短针，以解除小儿及家长害怕扎针的恐惧心理。
小儿针灸主治神经系统、消化系统、呼吸系统、心血管系统、泌尿系统、肌肉关节病、传染病、小儿外科、皮肤科的疾病，小儿惊厥、小儿发热、中暑、溺水等均可用针灸来进行治疗。
考虑小儿易哭闹，不与医生合作的特点容易损伤皮肤及肌肉，对于留针的小儿，可以根据临床医学经验，依照不同的疾病和病程，尽量减少留针时间。选穴时，可根据不同疾病、不同病情，进行精选，以尽可能少的穴位达到最好效果。
小儿针灸对于针刺的手法也有讲究，应快速进针，可减少进针时的痛苦，并作小幅提插捻转，待达到扎针效果后，马上出针。